Fakultete vykdomos trijų pakopų (bakalauro, magistro ir doktorantūros) studijos. Šiuo metu fakultetas metu vykdo 3 nuolatinių bakalauro studijų programas, 3 nuolatinių magistro studijų programas.

Archeologija (bakalauro ir magistro programos) – Archeologijos katedra, dalyvaujant visoms kitoms katedroms;

Istorija (bakalauro ir magistro programos) – Naujosios istorijos katedra, Istorijos teorijos ir kultūros istorijos katedra, Senovės ir vidurinių amžių istorijos katedra;
 

Kultūros istorija ir antropologija (bakalauro programa) – Istorijos teorijos ir kultūros istorijos katedra (Kultūrinių bendrijų studijų centras, Vilniaus Judaikos institutas), Naujosios istorijos katedra;

Paveldosauga (magistro programa) – Istorijos teorijos ir kultūros istorijos katedra (VšĮ Kultūros paveldo akademija, dalyvauja Kultūros paveldo centro prie Kultūros paveldo departamento (Kultūros ministerija) specialistai).

Istorikai apie istoriją